L’Afrique s’apprête à inclure officiellement les champignons, ou « funga », dans les systèmes de conservation aux côtés des plantes et animaux. Ce changement oblige à repenser l’évaluation des écosystèmes, la comptabilisation du carbone et l’allocation des fonds destinés à la conservation.
Par Bonface Orucho, agence Bird Story
Une analyse récente publiée en avril 2026 par The Guardian (quotidien britannique) présente ce changement comme l’émergence d’un mouvement africain de conservation des champignons, reliant de nouvelles preuves scientifiques à un plaidoyer coordonné à travers le continent.
Dans ce rapport, la scientifique malgache Anna Ralaiveloarisoa décrit les champignons comme « l’une des choses les plus importantes au monde… Ils nourrissent 90 % des plantes terrestres. Sans eux, il n’y aurait pas de vie sur Terre. »
Cette déclaration reflète un consensus scientifique croissant selon lequel les champignons sont à la base de la plupart des écosystèmes terrestres.
Des chercheurs et des défenseurs de l’environnement de différents pays, notamment Madagascar, la République démocratique du Congo, le Kenya et le Zimbabwe, militent désormais activement pour réintégrer les champignons dans les cadres de conservation qui les ont historiquement exclus.
Cette lacune est structurelle.
« La plupart des cadres de conservation n’ont pas été conçus pour prendre en compte les systèmes fongiques. Cela signifie que les décisions sont prises sur la base de données incomplètes », explique Fredrick Nyawanga, du Service forestier du Kenya.
Selon les scientifiques cités dans l’analyse du Guardian, cette omission est fondamentale.
De nouveaux outils scientifiques sont déjà en train de changer la donne en Afrique. La cartographie de l’ADN environnemental et la recherche sur le microbiome du sol permettent de mesurer la biodiversité fongique à grande échelle, révélant que de vastes écosystèmes souterrains restent largement méconnus.
« La science rattrape son retard sur le fonctionnement réel des écosystèmes. Une fois que l’on peut mesurer ce qui était invisible, on change la manière dont les décisions sont prises », a déclaré Nyawanga.
La base de référence fongique de Madagascar reste largement inachevée. Les chercheurs s’efforcent de classer les espèces dans un cadre de biodiversité où moins de 1 % des quelque 100 000 champignons estimés ont été formellement décrits.
Le Bénin a marqué un tournant politique en 2025. Le Congrès international sur la conservation des champignons a réuni des mycologues de 27 pays et a donné lieu à la Déclaration de Cotonou, qui appelle à l’intégration des champignons dans les cadres de conservation aux niveaux local, national et mondial.
Le Ghana s’est lancé dans la cartographie sur le terrain. La Société pour la protection des réseaux souterrains (SPUN), en collaboration avec l’Université du Ghana, a mené des prélèvements de mycorhizes (symbiose entre le champignon du sol et les racines d’une plante) dans des écosystèmes forestiers côtiers et tropicaux identifiés comme des zones à haute diversité.
L’Afrique du Sud met en place la couche technique. L’Institut national sud-africain de la biodiversité (SANBI) applique le codage à barres ADN au sein des systèmes de surveillance environnementale, ouvrant ainsi la voie à l’intégration de la détection des champignons dans des ensembles de données plus larges sur la biodiversité.
Sur la côte kenyane, on observe une évolution vers la recherche appliquée. Un projet 2026 mené par l’université de Pwani, en partenariat avec les Musées nationaux du Kenya et l’université de Nairobi, documente la biodiversité des sols dans les agro-écosystèmes, y compris les champignons bénéfiques et parasites, dans le but d’éclairer les décisions politiques.
Ailleurs, en Zambie, un outil de surveillance à l’échelle du système est en cours de test. African Parks déploie sa plateforme MENA, qui combine le séquençage de l’ADN environnemental et l’analyse des réseaux écologiques pour mesurer la biodiversité et l’intégrité des écosystèmes, fournissant ainsi un cadre permettant d’intégrer les données fongiques dans la gestion des zones protégées.
L’analyse du Guardian souligne que ces efforts constituent les premiers signes d’une évolution plus large d’alignement entre la recherche, les discussions politiques et le travail de terrain autour de la conservation des champignons.
« Ce ne sont que les premiers pas, mais ils indiquent la direction à suivre. Les pays commencent à mettre en place les systèmes de données qui faisaient défaut à la conservation », a déclaré Nyawanga.
Parallèlement, une dynamique institutionnelle commence à se mettre en place. La conférence Fungal Conservation Europe, qui s’est tenue en avril 2026 à Uppsala (Suède), a réuni des chercheurs et des acteurs politiques pour se concentrer explicitement sur la transposition de la science fongique en cadres de gouvernance. Les sessions ont porté sur l’intégration des champignons dans les systèmes de surveillance de la biodiversité, l’élargissement des évaluations de la Liste rouge et l’alignement de la conservation des champignons sur les accords mondiaux tels que la Convention sur la diversité biologique.
Le fossé politique reste toutefois important. Les cadres actuels en matière de biodiversité excluent encore largement les champignons des systèmes de reporting officiels, des objectifs de conservation et des structures de financement.
Cela crée une distorsion mesurable dans la façon dont les écosystèmes sont évalués, en particulier dans la comptabilité carbone et les indicateurs de restauration des terres.
« En Afrique, les implications sont plus marquées. Le continent abrite une biodiversité fongique vaste et largement non documentée dans les forêts tropicales, les savanes et les systèmes agricoles », selon Nyawanga.
« Pourtant, la plupart des stratégies nationales de conservation continuent de donner la priorité aux indicateurs de surface, ce qui signifie qu’une part importante de la valeur écologique reste non comptabilisée », a-t-il ajouté.
L’analyse du Guardian souligne que les systèmes de biodiversité et de carbone s’appuient sur des indicateurs mesurables pour allouer les ressources.
« Ce qui n’est pas mesuré n’est pas financé », a déclaré Nyawanga. « Les champignons sont au cœur de la productivité des sols et des processus liés au carbone, mais ils sont absents des indicateurs qui déterminent le financement. »
Le congrès sur la conservation des champignons de 2025, qui s’est tenu à Cotonou, au Bénin, a notamment marqué un tournant en inscrivant cette question à l’ordre du jour scientifique et politique africain. Les participants ont ensuite publié la Déclaration de Cotonou, appelant à la reconnaissance officielle des champignons dans les politiques de conservation aux niveaux national et mondial.
« Parallèlement, des campagnes mondiales voient le jour pour institutionnaliser ce changement. L’Engagement pour la conservation des champignons, lancé dans le cadre des processus de la Convention sur la diversité biologique, incite les pays à reconnaître les champignons comme un règne distinct au sein des cadres de biodiversité », a-t-il ajouté.
Des outils de suivi tels que le Fungal Conservation Tracker sont également en cours de développement pour surveiller la manière dont les pays intègrent les champignons dans leurs politiques et leurs pratiques de conservation.
Ces développements marquent une transition de la prise de conscience vers une mise en œuvre naissante. Les acteurs de la conservation ne se contentent plus de plaider pour la reconnaissance ; ils commencent à mettre en place les outils, les cadres et les coalitions nécessaires pour la concrétiser.
Ce changement redéfinit également la manière dont l’utilisation des terres et l’agriculture sont appréhendées. Les discussions politiques associent de plus en plus les systèmes fongiques à l’agroforesterie, à la restauration des sols et aux stratégies de résilience climatique.
« Il ne s’agit pas seulement de conservation, mais aussi de productivité », a déclaré Nyawanga. « Les systèmes fongiques ont un impact direct sur les rendements, la stabilité des sols et l’utilisation des terres à long terme. »
Partout en Afrique, cela ouvre de nouvelles perspectives. Les pays qui investissent dans la restauration des terres, l’agriculture régénérative et l’adaptation au changement climatique pourraient intégrer les systèmes fongiques dans la conception de leurs programmes, améliorant ainsi les résultats tout en renforçant leur position dans les négociations sur le climat.
L’implication plus large est une redéfinition de la conservation elle-même. Passer de la flore et de la faune à la flore, la faune et les champignons déplace l’attention des écosystèmes visibles vers les systèmes fonctionnels.
Cela permet une compréhension plus complète du fonctionnement des écosystèmes et de la manière dont la valeur est générée.
Pour l’Afrique, cela pourrait modifier son discours écologique. Le continent a longtemps été positionné dans les cadres mondiaux de conservation principalement à travers ses ressources faunistiques et forestières. L’intégration des champignons introduit une dimension de valeur écologique plus profonde, moins visible, mais potentiellement plus significative.
L’analyse du Guardian suggère que le changement passe de la reconnaissance scientifique à une prise en compte précoce dans les politiques, bien que l’intégration formelle reste limitée.
« La science est claire. Le problème réside dans la mise en œuvre. La question est de savoir à quelle vitesse les politiques rattraperont leur retard », a déclaré Nyawanga.
Article republié avec l’autorisation de Bird Story Agency, dans le cadre de notre partenariat de contenu.
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